小区楼顶防水可以使用SBS（Styrene-Butadiene-Styrene）卷材或防水涂料两种方式，具体选择取决于以下因素：

1. 预算：SBS卷材相对于防水涂料来说成本较高，所以预算是一个考虑因素。如果项目预算有限，防水涂料可能是更经济的选择。

2. 屋顶结构：SBS卷材适用于各种类型的屋顶结构，包括混凝土、金属和木质等。而防水涂料通常适用于平面或轻度倾斜的屋顶。

3. 施工技术要求：SBS卷材的施工技术要求较高，需要专业人员进行熔接和密封，施工难度较大。而防水涂料施工相对简单，可以通过刷涂或喷涂完成。

4. 耐久性和维护成本：SBS卷材通常具有较长的使用寿命，能够提供更好的耐久性和防水效果。而防水涂料的使用寿命相对较短，经过一段时间后可能需要重新涂覆或修补。

需要根据具体情况评估这些因素，选择适合的防水方式。在实际施工前，建议咨询专业的建筑师或防水工程师，以获得最佳的防水解决方案。